Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms