Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF1Q9UMS5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms