Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN2Q9ULH4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN2Q9ULH4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms