Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms