Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms