Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATXN10Q9UBB4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN10Q9UBB4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms