Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRNQ9P2B2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRNQ9P2B2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms