Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHRF1Q9P1Y6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHRF1Q9P1Y6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms