Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms