Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A12Q9NXJ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms