Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED29Q9NX70 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms