Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3EQ9NVU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms