Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A2Q9NTI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A2Q9NTI2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms