Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PKDREJQ9NTG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms