Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM60AQ9NP50 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms