Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-5Q9HDB9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms