Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms