Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC22Q9HCG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC22Q9HCG8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms