Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPJQ9HC77 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms