Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY9Q9HBG7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY9Q9HBG7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms