Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EBF2Q9HAK2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF2Q9HAK2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms