Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER2Q9H7U1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER2Q9H7U1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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