Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf42Q9H799 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms