Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms