Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP1Q9GZU7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTDSP1Q9GZU7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms