Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR88Q9GZN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR88Q9GZN0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms