Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR12Q9C0I1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms