Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL4Q9C0H6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms