Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms