Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms