Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIFKQ9BYG3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms