Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4AQ9BY43 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms