Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCAPERQ9BY12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms