Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A2Q9BY10 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms