Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAIPQ9BWF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms