Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms