Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms