Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf78Q9BR46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms