Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGIP1Q9BQI5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms