Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POP1Q99575 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POP1Q99575 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POP1Q99575 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POP1Q99575 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POP1Q99575 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POP1Q99575 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP1Q99575 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POP1Q99575 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms