Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SORT1Q99523 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms