Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIN3AQ96ST3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms