Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARXQ96QS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms