Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALS2Q96Q42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms