Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMG1Q96Q15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms