Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC115Q96NT0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms