Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf49Q96NF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms