Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms