Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms