Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCPIP1Q96JH7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms